Satelliten-DNA, DNA-Fraktionen, die sich bei Zentrifugation in CsCl-Gradienten von der Masse der DNA abtrennen lassen. S. ist in Zellkernen zahlreicher Eukaryonten nachgewiesen worden und macht beim Menschen etwa 1%, bei der Maus etwa 10 % der Kern-DNA aus. Sie weicht in der Basenzusammensetzung und der Dichte stark von der übrigen DNA ab. S. enthält mehr 5-Methylcytosin als die restliche Kern-DNA. Zur S. gehört die DNA des Nucleolus mit den Cistrons für die ribosomale RNA. Sie ist mit Hilfe cytologischer Hybridisierungsexperimente aber auch in verschiedenen Teilen der Chromosomen nachgewiesen worden; dort ist die Funktion ungeklärt. S. zeichnet sich oft durch hohe Redundanz aus. Bei der Maus liegen in jedem Molekül etwa 10⁶ Kopien zu je 150-300 Nucleotidpaaren vor, im Meerschweinchen etwa 10⁷ Kopien von nur sechs Basen der Folge GGGAAT. Der hohe Redundanzgrad hat eine schnelle Renaturierung nach Hitzedenaturierung zur Folge.

Extrachromosomale DNA wird ebenfalls zur S. gerechnet.