Clostripain (EC 3.4.22.8), eine SH-abhängige, trypsinähnliche Protease (M_r 50 kDa). C. hat Endopeptidase- und Amidase-Esterase-Aktivität und wurde aus Kulturfiltraten von Clostridium histolyticum isoliert. C. mit Endopeptidaseaktivität hydrolysiert Proteine, während C. mit Amidase-Esterase-Aktivität synthetische Aminosäureamid- und Aminosäureestersubstrate spaltet. Da C. nur Arginyl- und Lysylbindungen angreift, kann es zur Isolierung von großen Peptidfragmenten ohne vorherige chemische Modifizierung des Substrats eingesetzt werden.