Gapmer, von engl. gap, Lücke, Bezeichnung für chimäre Oligodesoxyribonucleotide, die beispielsweise am 5'- und am 3'-Ende anstelle der Internucleotidbindungen jeweils Methylphosphonatbindungen (Δ) enthalten, während die mittleren Bindungen zwischen den Nucleotiden Phosphorothionatbindungen (unterstrichen) sind: 5'-AΔCΔ*GΔTΔAC*GTCTCAGTΔAΔCΔ*GΔT-3' Darüber hinaus sind die Cytosinbausteine (*) in CpG-Sequenzen methyliert. Durch die Methylphosphonatbindungen wird die Lipophilie und Membrangängigkeit erhöht. G. haben Bedeutung für die Entwicklung neuer sequenzspezifischer Oligonucleotid-Therapeutika.