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Lexikon der Biologie: kompetitive PCR

kompetitive PCRw, eine Variante der RT-PCR, mit der quantitativ die mRNA (messenger-RNA) bestimmt werden kann. Wie bei der random-PCR wird zuerst durch reverse Transkription die zelluläre RNA in cDNA umgeschrieben. Bei der anschließenden Amplifikation mittels PCR (Polymerase-Kettenreaktion) konkurriert ein in einer bekannten Konzentration hinzugefügtes DNA-Fragment, das die gleiche primer-Zielsequenz (primer) besitzt, mit der cDNA um die primer-Bindung. Dieses zusätzlich hinzugefügte DNA-Fragment dient als interne Kontrolle unter der Annahme, daß die eigentliche Zielsequenz und das kompetitive DNA-Fragment mit der gleichen Effizienz amplifiziert werden. Die entstehenden PCR-Produkte unterscheiden sich in ihrer Größe. Mit dieser Methode kann man, vergleichbar mit der Northern-Technik (blotting-Techniken), über mRNA quantitative Informationen erhalten.

  • Die Autoren
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