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Lexikon der Biologie: Stringenz

Stringenzw, stringency (engl. = Strenge, Genauigkeit), im molekularbiologischen Sprachgebrauch die Beschreibung für den Grad der Exaktheit von bestimmten Bedingungen, Übereinstimmungen oder Paßgenauigkeiten. Bei hoher Stringenz müssen bestimmte Anforderungen besser erfüllt sein als bei niederer Stringenz. Insbesondere bei der Hybridisierung von Nucleinsäuren werden je nach Anwendung und Zielsetzung bestimmte, unterschiedlich stringente Bedingungen eingestellt. Hierbei spricht man von hoher Stringenz (high stringency), wenn die Reaktionsbedingungen bei der Hybridisierung so eingestellt sind, daß nur sehr gut zueinander passende, komplementäre Moleküle (Komplementarität) miteinander hybridisieren können. Alle Hybride mit einem (je nach genauen Bedingungen) hohen Anteil an Basen-Fehlpaarungen fallen wieder zu Einzelsträngen auseinander, unerwünschte Kreuzhybridisierungen können so meist unterdrückt werden. Niedere Stringenz (low stringency) oder nicht-stringente Bedingungen andererseits ermöglichen auch die partielle Hybridisierung von Molekülen mit mehr oder weniger großen Abschnitten ungepaarter bzw. fehlgepaarter Nucleinsäurebasen. Unter nieder-stringenten Bedingungen können auch nur entfernt ähnliche Nucleinsäuremoleküle zur Hybridisierung gebracht werden (Sequenzhomologie). Zur Einstellung bestimmter Grade der Stringenz bei Hybridisierungen muß die Schmelztemperatur (schmelzen, Tm-Wert) und somit der GC-Gehalt der zu untersuchenden Moleküle berücksichtigt werden, und es können die Parameter Temperatur, Salzgehalt und Formamidgehalt der Hybridisierungslösung variiert werden. Von unterschiedlich stringenten Bedingungen kann auch bei der Suche nach Sequenzmotiven in DNA- oder Protein-Sequenzdaten gesprochen werden – je nachdem, wie genau die gegebene Sequenz mit gefundenen ähnlichen Sequenzen übereinstimmen soll. Sequenz-alignment.

E.G.

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